物語の舞台は、日本の原風景の面影を残す、地方の小さな町「水天町」。
そこに住む3人の中学生、古森太郎、大神 信、中嶋匡幸は、それぞれ消し去ることのできない過去を持っている。
だからなのか、または違う理由なのか、3人は＜現世＞とは異なる世界、
＜幽世＞（かくりよ）へ魂（たま）抜けすることで行き来することが出来るようになる。
＜幽世＞とは人の亡霊の姿や遙か古代に死に絶えた生物の形を持つ「神霊」が住まうところ。
やがて＜幽世＞に起こりつつある異変のために、本来現れるはずのない「神霊」が
＜現世＞に現れ様々な悪影響を与え始める。
不思議な運命によって導かれた少年たちの＜現世＞と＜幽世＞、
二つの世界での大冒険が今始まる。

――彼らは、＜幽世＞の異変を食い止めることができるのか？
そしてこの異変の原因は？